游戏中的队长能够在插件配置中，自由的装配插件，镶嵌后数码兽就能得到相应属性的增强，同类的插件还能激活特殊的效果。

插件系统是游戏中除了进化之外的另一种提升属性的方式，该方式更加灵活。最初其实策划是想以套装形式来做，但太过雷同。最终将属性与额外技能做了拆分，形成了现在这种机制。

目前游戏中一共有21种类型的核心插件，能为数码兽提供核心效果的额外技能。能量、回馈、治疗、蓄力、弱点、增强、追击、反击、后发、巨人、吸取、突击、喘息、反弹、缓回、坚壁、净化、护盾、错乱、铁甲、巨盾。

而普通的插件有12种，给予额外属性加成，分别对应狂暴、爆裂、疾速、强击、防护、刚体、精准、抵抗、活力、狂气、战士、抵抗、活力、剑盾。

一般获得高品级的插件以及提升插件的等级，是提升数码兽属性和技能的的主要方式。插件一般可以通过战术演练副本来获取，不同的副本对应不同类型的插件，挑战成功则有概率得到相应的核心插件，此外天梯挑战赛玩法中完成任务也可以兑换核心插件。